การทำสมาธิเชิงลึกเป็นประจำซึ่งฝึกฝนเป็นเวลาหลายปีอาจช่วยควบคุมไมโครไบโอมในลำไส้และอาจลดความเสี่ยงต่อสุขภาพกายและสุขภาพจิต พบ การศึกษาเปรียบเทียบขนาดเล็กที่ตีพิมพ์ในวารสาร จิตเวชศาสตร์ จุลินทรีย์ในลำไส้ที่พบในพระสงฆ์ทิเบตกลุ่มหนึ่งแตกต่างจากเพื่อนบ้านฆราวาสอย่างมาก และเชื่อมโยงกับความเสี่ยงที่ลดลงของความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า และโรคหัวใจและหลอดเลือด การวิจัยแสดงให้เห็นว่าโปร ไบโอติกส์ ในลำไส้สามารถส่งผลต่ออารมณ์และพฤติกรรมผ่านแกนลำไส้และสมอง ซึ่งรวมถึงการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันของร่างกาย การส่งสัญญาณของฮอร์โมน การตอบสนองต่อความเครียด และเส้นประสาทเวกัส ซึ่งเป็นส่วนประกอบหลักของระบบประสาทพาราซิมพาเทติก ซึ่งควบคุมการทำงานของร่างกายที่สำคัญ