ภารกิจของสาธารณสุขคือการปกป้องและปรับปรุงสุขภาพของชุมชนโดยรวม การตอบสนองต่อภัยคุกคามจากโรคติดเชื้ออย่างมีประสิทธิภาพจึงต้องมีระบบสาธารณสุขที่แข็งแกร่ง ในสหรัฐอเมริกา การเฝ้าระวังทางสาธารณสุขสำหรับโรคติดเชื้อดำเนินการผ่านหน่วย กลุ่มโรค งานต่างๆ ผู้ให้บริการด้านสุขภาพและคนอื่นๆ รายงานกรณีของโรคติดเชื้อที่ต้องแจ้ง (ตามที่กำหนดโดยรหัสสุขภาพของท้องถิ่นและรัฐ) ไปยังหน่วยงานด้านสุขภาพของรัฐ ในทางกลับกัน เจ้าหน้าที่กระทรวงสาธารณสุขของรัฐจะตรวจสอบรายงานโรค ติดตามอุบัติการณ์ของโรค ระบุการระบาดที่เป็นไปได้ และส่งต่อการค้นพบไปยัง CDC CDC และหน่วยงานรัฐบาลกลางอื่นๆ รวมถึงสำนักงานคณะกรรมการอาหารและยา กระทรวงเกษตรของสหรัฐฯ และกระทรวงกลาโหมสหรัฐฯ รวบรวมและวิเคราะห์ข้อมูลเพื่อการเฝ้าระวังโรคโดยอิสระ ผู้สนับสนุนด้านสาธารณสุขเรียกร้องให้มีการเฝ้าระวังที่ดีขึ้นเพื่อติดตามโรคติดเชื้อทั่วประเทศ ข้อเสนอแนะ ได้แก่ ระบบรายงานโรคติดเชื้อทางอิเล็กทรอนิกส์แห่งชาติ วิธีการใหม่ในการเฝ้าระวังโรค (เช่น การรายงานทางห้องปฏิบัติการอัตโนมัติเกี่ยวกับโรคติดเชื้อ หรือการรวบรวมรายงานโรคอย่างไม่เป็นทางการจากอินเทอร์เน็ตอย่างเป็นระบบ) และสร้างความแข็งแกร่งให้กับระบบสาธารณสุขทั้งหมด ซึ่งในอดีตได้รับทุนสนับสนุนน้อยเมื่อเทียบกับการวิจัยทางชีวการแพทย์